鹽城市衛(wèi)生監(jiān)督所為依照公務(wù)員制度管理、副處級建制的事業(yè)單位，受市衛(wèi)生局委托，行使衛(wèi)生行政綜合執(zhí)法職能。內(nèi)設(shè)8個科室和1個開發(fā)區(qū)分所。各科室的主要職能為：辦公室負(fù)責(zé)行政、黨務(wù)、精神文明、人事、勞資、財務(wù)、檔案、圖書、車輛、總務(wù)后勤等管理工作；綜合業(yè)務(wù)（稽查）科負(fù)責(zé)各項業(yè)務(wù)工作的組織、協(xié)調(diào)、管理、督辦、考核，衛(wèi)生監(jiān)督執(zhí)法稽查和受理投訴舉報并組織查處、督辦和反饋等工作；衛(wèi)生許可審查科主要負(fù)責(zé)衛(wèi)生行政許可的受理、審查和出證等工作；政策法規(guī)（宣傳培訓(xùn)）科負(fù)責(zé)衛(wèi)生行政案件查處、宣傳培訓(xùn)、從業(yè)人員培訓(xùn)等工作；衛(wèi)生監(jiān)督一科牽頭負(fù)責(zé)食品及飲用水衛(wèi)生監(jiān)督監(jiān)測；衛(wèi)生監(jiān)督二科牽頭負(fù)責(zé)公共場所單位及校園內(nèi)食品衛(wèi)生監(jiān)督監(jiān)測；衛(wèi)生監(jiān)督三科負(fù)責(zé)醫(yī)療機(jī)構(gòu)、采供血機(jī)構(gòu)、幼托機(jī)構(gòu)、消殺產(chǎn)品衛(wèi)生質(zhì)量以及傳染病防治監(jiān)督監(jiān)測；衛(wèi)生監(jiān)督四科負(fù)責(zé)職業(yè)衛(wèi)生、放射衛(wèi)生監(jiān)督監(jiān)測；開發(fā)區(qū)分所承擔(dān)開發(fā)區(qū)境內(nèi)衛(wèi)生監(jiān)督監(jiān)測綜合管理職能。
該所成立以來，在市委、市政府和市衛(wèi)生局的正確領(lǐng)導(dǎo)以及社會各有關(guān)部門的關(guān)心支持下，始終堅持以“三個代表”重要思想和科學(xué)發(fā)展觀為指導(dǎo)，以“為人民健康服務(wù)，為經(jīng)濟(jì)發(fā)展服務(wù)，為構(gòu)建和諧社會服務(wù)”為宗旨，以“依法行政，文明執(zhí)法，遵紀(jì)守法”為要求，大力弘揚“與時俱進(jìn)，創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)”的精神，實現(xiàn)了“三個文明協(xié)調(diào)發(fā)展，兩個效益同步提高”的奮斗目標(biāo)，先后被市委、市政府表彰為“抗擊非典先進(jìn)集體”、“打假工作先進(jìn)集體”等，并獲得省文明單位、市文明標(biāo)兵單位等一系列殊榮。
加強(qiáng)行風(fēng)職業(yè)道德建設(shè)、樹立衛(wèi)生監(jiān)督機(jī)構(gòu)新形象是該所常抓不懈的工作，在向社會作出公開承諾、主動接受社會監(jiān)督的同時，主動加強(qiáng)內(nèi)部管理，使該項工作取得了長足進(jìn)展。全所干部職工熱忱歡迎社會各界繼續(xù)給予關(guān)心支持與監(jiān)督指導(dǎo)。